Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms