Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ndufs3Q9DCT2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ndufs3Q9DCT2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufs3Q9DCT2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms