Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms