Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3fQ9DCH4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms