Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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