Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms