Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms