Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms