Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrpraQ9DBG7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms