Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Med29Q9DB91 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Med29Q9DB91 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms