Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp8Q9DB85 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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