Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TrmuQ9DAT5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TrmuQ9DAT5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TrmuQ9DAT5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TrmuQ9DAT5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms