Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph3bQ9DA80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms