Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D9H8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D9H8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms