Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd2Q9D8U0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms