Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms