Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chp2Q9D869 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms