Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
2310002L09RikQ9D7L5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms