Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms