Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms