Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms