Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms