Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn11Q9D572 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms