Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7Q9D541 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms