Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4931428L18RikQ9D4S9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms