Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms