Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms