Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms