Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5530401A14RikQ9D3H9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5530401A14RikQ9D3H9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms