Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsig1Q9D2J4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms