Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms