Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms