Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms