Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms