Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Upk1aQ9D132 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Upk1aQ9D132 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1aQ9D132 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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