Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms