Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms