Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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