Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms