Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms