Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snf8Q9CZ28 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms