Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prelid3bQ9CYY7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prelid3bQ9CYY7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms