Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ube2fQ9CY34 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ube2fQ9CY34 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ube2fQ9CY34 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ube2fQ9CY34 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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