Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms