Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms