Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd8Q9CX56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms