Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Yif1bQ9CX30 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms