Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms