Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pin4Q9CWW6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms