Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms